Geodesic
Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences
Atti della Accademia nazionale dei Lincei. Rendiconti della Classe di scienze fisiche, matematiche e naturali, Série 8, Tome 74 (1983) no. 6, pp. 389-395 Cet article a éte moissonné depuis la source Biblioteca Digitale Italiana di Matematica

Voir la notice de l'article

Viene presentato un nuovo approccio allo studio di sequenze nucleotidiche basato su calcoli di serie Fourier. La sequenza nucleotidica di un gene, rappresentabile mediante i simboli delle quattro basi $(A,T,G,C)$ viene risolta in quattro sequenze «omonucleotidiche» che vengono considerate ciascuna come un reticolo lineare caratterizzato dalla ripetizione di una base e di «vacanze» (X) corrispondenti alle tre rimanenti basi. Viene calcolata la Trasformata di Fourier (F.T.). Successivamente vengono calcolate delle serie di Fourier aventi come coefficienti i quadrati dei valori assoluti della Trasformata di Fourier. Si ottiene così una funzione $D(x)$ del tutto analoga alla «funzione Patterson», largamente impiegata nell’analisi strutturale dei cristalli. I massimi della funzione $D(x)$ corrispondono a vettori i cui moduli rappresentano distanze fra basi identiche nella sequenza nucleotidica del gene. Questa funzione viene mostrata per il gene della globina dell'Aplisia. La funzione contiene picchi corrispondenti a distanze di 3 unità e multiple di 3 (3, 6, 12, 15,...). 
@article{RLINA_1983_8_74_6_a9,
     author = {Liquori, Alfonso M. and Ottani, Stefano and Ripamonti, Alberto and Sadun, Claudia},
     title = {Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences},
     journal = {Atti della Accademia nazionale dei Lincei. Rendiconti della Classe di scienze fisiche, matematiche e naturali},
     pages = {389--395},
     year = {1983},
     volume = {Ser. 8, 74},
     number = {6},
     language = {en},
     url = {http://geodesic.mathdoc.fr/item/RLINA_1983_8_74_6_a9/}
}
TY  - JOUR
AU  - Liquori, Alfonso M.
AU  - Ottani, Stefano
AU  - Ripamonti, Alberto
AU  - Sadun, Claudia
TI  - Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences
JO  - Atti della Accademia nazionale dei Lincei. Rendiconti della Classe di scienze fisiche, matematiche e naturali
PY  - 1983
SP  - 389
EP  - 395
VL  - 74
IS  - 6
UR  - http://geodesic.mathdoc.fr/item/RLINA_1983_8_74_6_a9/
LA  - en
ID  - RLINA_1983_8_74_6_a9
ER  - 
%0 Journal Article
%A Liquori, Alfonso M.
%A Ottani, Stefano
%A Ripamonti, Alberto
%A Sadun, Claudia
%T Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences
%J Atti della Accademia nazionale dei Lincei. Rendiconti della Classe di scienze fisiche, matematiche e naturali
%D 1983
%P 389-395
%V 74
%N 6
%U http://geodesic.mathdoc.fr/item/RLINA_1983_8_74_6_a9/
%G en
%F RLINA_1983_8_74_6_a9
Liquori, Alfonso M.; Ottani, Stefano; Ripamonti, Alberto; Sadun, Claudia. Genes as quasi-periodic linear lattices: a novel approach to the analysis of nucleotide sequences. Atti della Accademia nazionale dei Lincei. Rendiconti della Classe di scienze fisiche, matematiche e naturali, Série 8, Tome 74 (1983) no. 6, pp. 389-395. http://geodesic.mathdoc.fr/item/RLINA_1983_8_74_6_a9/